检查

DOI:10.18129 / B9.bioc.INSPEcT

4sU-seq和RNA-seq时间过程数据分析

Bioconductor版本:Release (3.6)

INSPEcT(时间过程实验中合成、加工和降解速率的推断)分析4sU-seq和RNA-seq时间过程数据,以评估合成、加工和降解速率,并通过建模确定成熟mRNA水平变化的速率进行评估。

作者:Stefano de Pretis

维护者:Stefano de Pretis

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细节

biocViews GeneRegulationRNASeq测序软件SystemsBiologyTimeCourse
版本 1.8.0
在Bioconductor BioC 3.2 (R-3.2)(2.5年)
许可证 GPL-2
取决于 R(>= 3.2),方法,BiobaseBiocParallel
进口 pROCdeSolverootSolve编译器,preprocessCoreGenomicFeaturesGenomicRangesIRangesBiocGenericsGenomicAlignmentsRsamtoolsS4Vectors
链接
建议 BiocStyleknitrTxDb.Mmusculus.UCSC.mm9.knownGene
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源包 INSPEcT_1.8.0.tar.gz
Windows二进制 INSPEcT_1.8.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) INSPEcT_1.8.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/INSPEcT
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/INSPEcT/
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