HiTC

DOI:10.18129 / B9.bioc.HiTC

高吞吐量染色体构象捕获分析

Bioconductor版本:版本(3.6)

类似的HiTC包开发探索大规模“C”数据,如5 C或高C。专用R类以及质量控制的标准方法,标准化,可视化,同时还提供了进一步的分析。

作者:尼古拉斯的仆人

维护人员:尼古拉斯仆人<尼古拉斯。仆人在curie.fr >

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细节

biocViews	嗝,HighThroughputSequencing,测序,软件
版本	1.22.1
Bioconductor自	BioC 2.10 (r - 2.15)(6年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R(> = 2.15.0)、方法IRanges,GenomicRanges
进口	Biostrings、图形、grDevicesrtracklayer,RColorBrewer,矩阵平行,GenomeInfoDb
链接
建议	BiocStyle,HiCDataHumanIMR90
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我	HiCDataHumanIMR90
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	HiTC_1.22.1.tar.gz
Windows二进制	HiTC_1.22.1.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	HiTC_1.22.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/HiTC
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/HiTC/
包下载报告	下载数据
老BioC 3.6源码包	源存档