HTSFilter

DOI:10.18129 / B9.bioc.HTSFilter

筛选复制的高通量转录组测序数据

Bioconductor版本:Release (3.6)

该包实现了基于全球Jaccard相似指数的复制转录组测序数据的过滤程序，以便在一个或多个实验条件下识别低表达水平恒定的基因。

作者:Andrea Rau, Melina Gallopin, Gilles Celeux, Florence Jaffrezic

维护者:Andrea Rau < Andrea。Rau在jouy.inra.fr>

安装

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##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“HTSFilter”)

文档

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PDF	R脚本	HTSFilter装饰图案
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DifferentialExpression，GeneExpression，归一化，预处理，RNASeq，测序，软件
版本	1.18.0
在Bioconductor	BioC 2.12 (R-3.0)(5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 3.4.0)
进口	刨边机(> = 3.9.14),DESeq2(> = 1.10.1),DESeq(> = 1.22.1),BiocParallel(> = 3),Biobase， utils，统计，grDevices，图形，方法
链接
建议	EDASeq(> = 2.1.4),BiocStyle，testthat
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我	coseq
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	HTSFilter_1.18.0.tar.gz
Windows二进制	HTSFilter_1.18.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	HTSFilter_1.18.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/HTSFilter
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/HTSFilter/
软件包下载报告	下载数据