Glimma

DOI:10.18129 / B9.bioc.Glimma

交互式HTML图形

Bioconductor版本:Release (3.6)

该软件包使用HTML页面中的limma, edgeR或DESeq2包的输出生成rna测序数据的交互式可视化分析。交互构建在分析结果的流行静态表示之上，以便提供额外的信息。

作者:苏诗安、马修·e·里奇、《慈善法》、斯图尔特·李

维护者:Shian Su < Su。S at wehi.edu.au>

安装

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##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“Glimma”)

文档

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browseVignettes(“Glimma”)

PDF	R脚本	Glimma装饰图案
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	DifferentialExpression，GeneExpression，微阵列，RNASeq，ReportWriting，测序，软件，可视化
版本	1.6.0
在Bioconductor	BioC 3.3 (R-3.3)(2年)
许可证	GPL-3 |文件LICENSE
取决于	R (>= 3.4.0)
进口	Biobase，刨边机grDevices,jsonlite，方法，统计，S4Vectors,跑龙套
链接
建议	BiocStyle，DESeq2，limma，testthat，knitr，rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/Shians/Glimma
BugReports	https://github.com/Shians/Glimma/issues
全靠我
进口我	EGSEA
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	Glimma_1.6.0.tar.gz
Windows二进制	Glimma_1.6.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	Glimma_1.6.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Glimma
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/Glimma/
软件包下载报告	下载数据