GenomicDataCommons

DOI:10.18129 / B9.bioc.GenomicDataCommons

NIH / NCI基因组数据共享访问

Bioconductor版本:Release (3.6)

以编程方式访问NIH / NCI基因组数据共享RESTful服务。

作者:Martin Morgan [aut], Davis Sean [aut, cre]

维护者:Davis Sean

引文(从R内,输入引用(“GenomicDataCommons”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“基因组数据共通”)

文档

超文本标记语言 R脚本 介绍访问NCI基因组数据共享
PDF 参考手册

细节

biocViews DataImport测序软件
版本 1.2.0
在Bioconductor BioC 3.5 (R-3.4)(1年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (>= 3.4.0),magrittr
进口 统计数据,httrxml2jsonlite跑龙套,lazyevalreadrdata.tableGenomicRangesIRanges
链接
建议 BiocStyleknitrrmarkdownDTtestthat列表视图ggplot2GenomicAlignmentsRsamtools
SystemRequirements
增强了
URL //www.anjoumacpherson.com/packages/GenomicDataCommonshttp://github.com/Bioconductor/GenomicDataCommons
BugReports https://github.com/Bioconductor/GenomicDataCommons/issues/new
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包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 GenomicDataCommons_1.2.0.tar.gz
Windows二进制 GenomicDataCommons_1.2.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) GenomicDataCommons_1.2.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GenomicDataCommons
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/GenomicDataCommons/
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