GenomeInfodB

doi：10.18129/b9.bioc.genomeinfodb

操纵染色体和其他“ seqname”标识符的实用程序

生物导体版本：版本（3.6）

包含定义并允许在不同染色体序列命名约定（例如“ Chr1” Vers“ 1”）之间进行翻译的数据和函数，其中包括试图将序列名称放置在其自然而不是词典学顺序中的函数。

作者：Sonali Arora，Martin Morgan，Marc Carlson，H。Pagès

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PDF		参考手册
文本		消息
视频		简单的任务基因组知行

细节

生物浏览	注解，，，，datarepresentation，，，，遗传学，，，，基因数，，，，软件
版本	1.14.0
在生物导体中	Bioc 2.14（R-3.1）（4年）
执照	艺术2.0
要看	r（> = 3.1），方法，生物基因（> = 0.13.8），S4VECTORS（> = 0.9.25），iranges（> = 1.99.26）
进口	Stats，Stats4，Utils，rcurl，，，，GenomeInfodBdata
链接
建议	基因组机，，，，rsamtools，，，，基因组签名，，，，BSGENOME，，，，GenomicFeatures，，，，BSGENOME.SCEREVISIAE.UCSC.SACCER2，，，，bsgenome.celegans.ucsc.ce2，，，，bsgenome.hsapiens.ncbi.grch38，，，，txdb.dmelanogaster.ucsc.dm3.ensgene，，，，运行，，，，生物使用，，，，尼特
系统要求
增强
URL
取决于我	BSGENOME，，，，Bumphunter，，，，芯片，，，，法典，，，，CSAR，，，，基因组签名，，，，GenomicFeatures，，，，基因组机，，，，基因组菌，，，，GMAPR，，，，grohmm，，，，Helloranges，，，，htseqtools，，，，IDEOVIZ，，，，甲基分析，，，，rsamtools，，，，snplocs.hsapiens.dbsnp141.grch38，，，，snplocs.hsapiens.dbsnp142.grch37，，，，变体，，，，xtrasnplocs.hsapiens.dbsnp141.grch38
进口我	等位基因平衡，，，，高山，，，，扩增器，，，，Aneufinder，，，，AnnotationHubdata，，，，Annotatr，，，，atacseqqc，，，，Baalchip，，，，舞会礼服，，，，BasicStarrseq，，，，Biovizbase，，，，Biseq，，，，BNBC，，，，分支机构，，，，BSGENOME，，，，BSSEQ，，，，卡斯珀，，，，cexor，，，，Chimeraviz，，，，Chipenrich，，，，chipenrich.data，，，，chipexoqual，，，，Chippeakanno，，，，Chipseeker，，，，Chromstar，，，，Chromvar，，，，Cindex，，，，CN. -ops，，，，CNER，，，，cnpbayes，，，，Compepitools，，，，共识，，，，Conumee，，，，copywriter，，，，crisprvariants，，，，CSAW，，，，CustomProdb，，，，深布鲁尔，，，，德芬德，，，，derfinderplot，，，，Diffhic，，，，diffloop，，，，EasyRnaseq，，，，埃尔默，，，，Ensembldb，，，，ememblvep，，，，Epgenomix，，，，epivizrdata，，，，EPIVIZRSTANTALLONE，，，，esatac，，，，EventPointer，，，，外观复制，，，，Funchip，，，，Funtoonorm，，，，ga4ghclient，，，，ga4ghshiny，，，，GCAPC，，，，GenBankr，，，，基因贡献，，，，Genogam，，，，基因组化，，，，基因组合，，，，Genomicfiles，，，，基因组间，，，，GenomicsCores，，，，Genoset，，，，Genotypeeval，，，，GGBIO，，，，ggtools，，，，GoogleGenomics，，，，gqtlstats，，，，grasp2db，，，，Greylistchip，，，，Guideseq，，，，GVIZ，，，，Gwascat，，，，H5VC，，，，热图，，，，HITC，，，，htseqgenie，，，，IMAS，，，，inpas，，，，互动集，，，，同工型间分析仪，，，，IVAS，，，，核粒子，，，，ldblock，，，，Madseq，，，，metagene，，，，metavizr，，，，甲基，，，，甲基赫里西氏菌，，，，甲基库，，，，甲基管，，，，甲基菌，，，，methyvim，，，，Minfi，，，，最小值，，，，马赛克，，，，Motifbreakr，，，，MotifMatchr，，，，MSGBSR，，，，突变模式，，，，myvariant，，，，NADFINDER，，，，狭窄，，，，NORMR，，，，有机体，，，，panelcn.mops，，，，pi，，，，podkat，，，，Prebs，，，，蛋白质组学杂志，，，，属属，，，，qpgraph，，，，QSEA，，，，准，，，，R3CPET，，，，R3CSEQ，，，，Rarevariantvis，，，，稀有，，，，rcade，，，，RCAS，，，，RCGH，，，，叙事，，，，区域人，，，，地区报告，，，，repitools，，，，肋骨蛋白，，，，riboseqr，，，，RJMCMCN核小体，，，，怒吼，，，，rtcgatoolbox，，，，rtracklayer，，，，片段，，，，Seqarray，，，，seqcat，，，，seqplots，，，，sgseq，，，，Shortread，，，，Snpchip，，，，Snphood，，，，snplocs.hsapiens.dbsnp141.grch38，，，，snplocs.hsapiens.dbsnp142.grch37，，，，snplocs.hsapiens.dbsnp144.grch37，，，，snplocs.hsapiens.dbsnp144.grch38，，，，snplocs.hsapiens.dbsnp149.grch38，，，，snplocs.hsapiens.dbsnp150.grch38，，，，soggi，，，，躯体签名，，，，剪接图，，，，碎片，，，，斯坦，，，，总结性特征，，，，tarseqqc，，，，tcgabiolinks，，，，TFBSTOOLS，，，，Titancna，，，，TNT，，，，TrackViewer，，，，transcriptr，，，，tsrchitect，，，，TVTB，，，，香草，，，，变体滤波器，，，，变体工具，，，，WigglePlotr，，，，xtrasnplocs.hsapiens.dbsnp141.grch38，，，，xtrasnplocs.hsapiens.dbsnp144.grch37，，，，xtrasnplocs.hsapiens.dbsnp144.grch38，，，，yapsa，，，，yrimulti
建议我	注释，，，，AnnotationHub，，，，实验室，，，，GQTLBASE，，，，QDNASEQ，，，，补偿
构建报告

包装档案

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源包	GenomeInfodB_1.14.0.tar.gz
Windows二进制	GenomeInfodB_1.14.0.zip
Mac OS X 10.11（El Capitan）	GenomeInfodB_1.14.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/genomeinfodb
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/genomeinfodb/
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