GenVisR

DOI:10.18129 / B9.bioc.GenVisR

在R基因可视化

Bioconductor版本:版本(3.6)

主要生产高度可定制的出版质量基因组数据的图形在队列级别。

作者:圣扎迦利斯基德莫尔(aut (cre),亚历克斯·瓦格纳(aut)罗伯特·Lesurf (aut),凯蒂·坎贝尔(aut),杰森Kunisaki (aut), Obi格里菲斯(aut),玛拉基书格里菲斯(aut)

维护人员:扎卡里·斯基德莫尔< zlskidmore gmail.com >

安装

安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“GenVisR”)

文档

HTML	R脚本	GenVisR:介绍
HTML	R脚本	瀑布:功能介绍
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	分类,DNASeq,DataRepresentation,基础设施,软件
版本	1.8.1
Bioconductor自	BioC 3.3 (r - 3.3)(2年)
许可证	GPL-3 +文件许可
取决于	R (> = 3.3.0)
进口	AnnotationDbi,biomaRt,BiocGenerics,Biostrings,DBI,FField,GenomicFeatures,GenomicRanges(> = 1.25.4),ggplot2(> =魅惑,网格,gridExtra,gtable,gtools,IRanges(> = 2.7.5),plyr(> = 1.8.3),reshape2,Rsamtools,尺度,统计,跑龙套,冬青
链接
建议	BiocStyle,BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19,knitr,RMySQL,roxygen2,testthat,TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene,rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports	https://github.com/griffithlab/GenVisR/issues
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	GenVisR_1.8.1.tar.gz
Windows二进制	GenVisR_1.8.1.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	GenVisR_1.8.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GenVisR
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/GenVisR/
包下载报告	下载数据
老BioC 3.6源码包	源存档