哥特

DOI:10.18129 / B9.bioc.GOTHiC

二项测试高c数据分析

Bioconductor版本:版本(3.6)

这是一个高c分析包使用累积二项测试来检测远端基因位点之间的交互,更读的机会比预期高c实验。需要映射配对挥动读取列表作为输入,并回馈重要的对于一个给定的基因组中本大小的交互。

作者:Borbala Mifsud和罗伯特糖

维护人员:Borbala Mifsud < b。在qmul.ac.uk mifsud >

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PDF	R脚本	package_vignettes.pdf
PDF		参考手册

细节

biocViews	表观遗传学,嗝,预处理,测序,软件
版本	1.14.0
Bioconductor自	BioC 2.14 (r - 3.1)(4年)
许可证	GPL-3
取决于	R(> = 2.15.1)、方法、效用,GenomicRanges,Biostrings,BSgenome,data.table
进口	BiocGenerics,S4Vectors(> = 0.9.38),IRanges,Rsamtools,ShortRead,rtracklayer,ggplot2
链接
建议	HiCDataLymphoblast
SystemRequirements
增强了	平行
URL
取决于我
进口我
建议我	HiCDataLymphoblast
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	GOTHiC_1.14.0.tar.gz
Windows二进制	GOTHiC_1.14.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	GOTHiC_1.14.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GOTHiC
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/GOTHiC/
包下载报告	下载数据