GOSim

DOI:10.18129 / B9.bioc.GOSim

计算功能相似的条款和基因产物;去富集分析

Bioconductor版本:版本(3.6)

这个方案实现了几个函数用于计算相似性和基因产品基于他们的注释。而且它允许计算富集分析

作者:Holger Froehlich < frohlich在bit.uni-bonn.de >

维修工:Holger Froehlich < frohlich在bit.uni-bonn.de >

从内部引用(R,回车引用(“GOSim”)):

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PDF R脚本 GOsim
PDF 参考手册

细节

biocViews 聚类,,通路,软件
版本 1.16.0
Bioconductor自 BioC 2.13 (r - 3.0)(4.5年)
许可证 GPL (> = 2)
取决于 GO.db,注释
进口 org.Hs.eg.db,AnnotationDbi,topGO,集群,flexmix,RBGL,,矩阵,corpcor,Rcpp
链接 Rcpp
建议
SystemRequirements
增强了 igraph
URL
取决于我
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包档案

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源包 GOSim_1.16.0.tar.gz
Windows二进制 GOSim_1.16.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) GOSim_1.16.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GOSim
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/GOSim/
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