Gosemsim

doi:10.18129/b9.bioc.gosemsim

Go-Terms语义相似性度量

生物导体版本:版本(3.6)

基因本体论(GO)注释的语义比较提供了计算基因和基因组之间相似性的定量方法,并已成为许多生物信息学分析方法的重要基础。Gosemsim是用于语义相似性计算,GO术语,GO术语,基因产品和基因簇之间的R套件。Gosemsim分别实施了Resnik,Schlicker,Jiang,Lin和Wang提出的五种方法。

作者:广琴Yu [AUT,CRE],Alexey Stukalov [CTB],Chuanle Xiao [CTB],LluísRevillaSancho [CTB]

维护者:gmail.com> guangchuang yu

引用(从r内,输入引用(“ Gosemsim”)):

安装

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##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ gosemsim”)

文档

html R脚本 Gosemsim介绍
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 注解,,,,聚类,,,,,,,,网络,,,,途径,,,,软件
版本 2.4.1
在生物导体中 Bioc 2.4(R-2.9)(9年)
执照 艺术2.0
要看 r(> = 3.3.2)
进口 AnnotationDbi,,,,go.db,方法,utils
链接 RCPP
建议 AnnotationHub,,,,Biocinstaller,,,,clusterProfiler,,,,剂量,,,,尼特,,,,org.hs.eg.db,,,,Prettydoc,,,,测试
系统要求
增强
URL https://guangchuangyu.github.io/gosemsim
BugReports https://github.com/guangchuangyu/gosemsim/issues
取决于我 翻译
进口我 Biomedr,,,,clusterProfiler,,,,剂量,,,,网眼,,,,rcpi
建议我 生物剂,,,,Epinem,,,,精灵
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 gosemsim_2.4.1.tar.gz
Windows二进制 gosemsim_2.4.1.zip(32-和64位)
Mac OS X 10.11(El Capitan) gosemsim_2.4.1.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/gosemsim
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/gosemsim/
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