GENIE3

DOI:10.18129 / B9.bioc.GENIE3

树集合的基因网络推理

Bioconductor版本:Release (3.6)

这个包实现了GENIE3算法,用于从表达数据推断基因调控网络。

作者:Van Anh Huynh-Thu, Sara Aibar, Pierre Geurts

维护者:Van Anh Huynh-Thu

引文(从R内,输入引用(“GENIE3”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“GENIE3”)

文档

超文本标记语言 R脚本 GENIE3
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文本 新闻

细节

biocViews DecisionTreeGeneExpressionGraphAndNetwork网络NetworkInference回归软件SystemsBiology
版本 1.0.0
许可证 GPL (>= 2)
取决于
进口 统计数据,reshape2
链接
建议 knitrrmarkdownforeachdoRNGdoParallelBiobaseSummarizedExperimenttestthat、方法
SystemRequirements
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包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 GENIE3_1.0.0.tar.gz
Windows二进制 GENIE3_1.0.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan) GENIE3_1.0.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GENIE3
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/GENIE3/
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