FunciSNP

DOI:10.18129 / B9.bioc.FunciSNP

集成功能的非编码数据集与识别候选基因关联研究监管snp

Bioconductor版本:版本(3.6)

从GWAS FunciSNP集成信息,1000和染色质特征识别功能基因组SNP编码或非编码区域。

作者:西蒙·g·Coetzee西蒙< simoncoetzee.com >和Houtan Noushmehr博士< Houtan在usp.br >

维护人员:西蒙·g·Coetzee西蒙< simoncoetzee.com >

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文本		新闻

细节

biocViews	注释,DataImport,DataRepresentation,基础设施,SequenceMatching,软件
版本	1.22.0
Bioconductor自	BioC 2.11 (r - 2.15)(5.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 2.14.0),ggplot2,TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene,FunciSNP.data
进口	方法,BiocGenerics,Biobase,S4Vectors,IRanges,GenomicRanges,Rsamtools(> = 1.6.1),rtracklayer(> = 1.14.1),ChIPpeakAnno(> = 2.2.0),VariantAnnotation,plyr,snpStats,ggplot2(> = 0.9.0),重塑(> = 0.8.4),尺度
链接
建议	org.Hs.eg.db
SystemRequirements
增强了	平行
URL	http://coetzeeseq.usc.edu/publication/Coetzee_SG_et_al_2012/
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源包	FunciSNP_1.22.0.tar.gz
Windows二进制	FunciSNP_1.22.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	FunciSNP_1.22.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/FunciSNP
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/FunciSNP/
包下载报告	下载数据