FGNet

DOI:10.18129 / B9.bioc.FGNet

功能基因网络来源于生物富集分析

Bioconductor版本:版本(3.6)

构建和可视化功能基因和浓缩的聚类分析在多个注释术语网络空间。包包括一个图形用户界面(GUI)和功能进行功能富集分析通过大卫,GeneTerm链接器,计(GSEA)和topGO。

作者:Sara Aibar,西莉亚Fontanillo,康拉德Droste和哈维尔·De Las里瓦斯。

维护人员:莎拉Aibar < saibar在usal.es >

安装

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文档

HTML	R脚本	FGNet
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文本		新闻

细节

biocViews	注释,聚类,FunctionalGenomics,去,GeneSetEnrichment,网络,NetworkEnrichment,通路,软件,可视化
版本	3.12.0
Bioconductor自	BioC 2.13 (r - 3.0)(4.5年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (> = 2.15)
进口	igraph(> = 0.6),hwriter,R.utils,XML,plotrix,reshape2,RColorBrewer,png
链接
建议	RGtk2,RCurl,RDAVIDWebService,计,topGO,KEGGprofile,GO.db,KEGG.db,reactome.db,RUnit,BiocGenerics,org.Sc.sgd.db,knitr,rmarkdown,AnnotationDbi
SystemRequirements
增强了
URL	http://www.cicancer.org
取决于我
进口我	IntramiRExploreR
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	FGNet_3.12.0.tar.gz
Windows二进制	FGNet_3.12.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	FGNet_3.12.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/FGNet
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/FGNet/
包下载报告	下载数据