ExiMiR

DOI:10.18129 / B9.bioc.ExiMiR

R函数用于Exiqon miRNA阵列数据的归一化

Bioconductor版本:Release (3.6)

这个包包含一些函数,用于从Exiqon miRCURY LNA数组中读取ImaGene TXT格式的原始数据,用适当的GAL文件注释它们,并使用基于探针的插入方法对它们进行规范化。还支持其他平台和数据格式。

作者:Sylvain Gubian ,Alain Sewer , PMP SA

维护者:Sylvain Gubian

引文(从R内,输入引用(“ExiMiR”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“ExiMiR”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“ExiMiR”)

PDF R脚本 ExiMiR的描述
PDF 参考手册
文本 新闻
文本 许可证

细节

biocViews GeneExpression微阵列OneChannel预处理软件转录TwoChannel
版本 2.20.0
在Bioconductor BioC 2.8 (R-2.13)(7年)
许可证 GPL-2
取决于 R (>= 2.10),Biobase(> = 2.5.5),affy(> = 1.26.1),limma
进口 affyio(> = 1.13.3),Biobase(> = 2.5.5),preprocessCore(> = 1.10.0)
链接
建议 mirna10cdf
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 ExiMiR_2.20.0.tar.gz
Windows二进制 ExiMiR_2.20.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) ExiMiR_2.20.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ExiMiR
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/ExiMiR/
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