EBImage

DOI:10.18129 / B9.bioc.EBImage

图像处理与分析工具箱为R

Bioconductor版本:版本(3.6)

EBImage提供通用功能进行图像处理和分析。(高通量)的上下文中microscopy-based细胞化验,EBImage提供工具来段细胞和提取细胞定量描述符。这允许使用R编程语言的自动化任务和促进其他工具的使用R信号处理、环境统计建模、机器学习和图像数据可视化。

作者:Andrzej Oleś,格雷戈勒保罗,迈克史密斯,奥列格•Sklyar沃尔夫冈•休伯约瑟夫·巴里和菲利普·a·玛莱的贡献

维护人员:Andrzej Oleś< Andrzej。ole在embl.de >

从内部引用(R,回车引用(“EBImage”)):

安装

安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“EBImage”)

文档

HTML R脚本 介绍EBImage
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 软件,可视化
版本 4.20.1
Bioconductor自 BioC 1.8 (r - 2.3)(12年)
许可证 LGPL
取决于
进口 BiocGenerics(> =是0.7.1)、方法、图形grDevices,统计数据,abind,tiff,jpeg,png,locfit,fftwtools7(> = 0.9),跑龙套,htmltools,htmlwidgets,RCurl
链接
建议 BiocStyle,消化,knitr,rmarkdown,闪亮的
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/aoles/EBImage
BugReports https://github.com/aoles/EBImage/issues
取决于我 CRImage,DonaPLLP2013,FISHalyseR,flowcatchR,furrowSeg,HD2013SGI,imageHTS,PGPC
进口我 bnbc,承认,flowCHIC,的热图,MaxContrastProjection,山药
建议我 DmelSGI,ggtree,HilbertVis,tofsims
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 EBImage_4.20.1.tar.gz
Windows二进制 EBImage_4.20.1.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) EBImage_4.20.1.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/EBImage
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/EBImage/
包下载报告 下载数据
老BioC 3.6源码包 源存档

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