DiffBind

DOI:10.18129 / B9.bioc.DiffBind

ChIP-Seq峰值数据的差分绑定分析

Bioconductor版本:Release (3.6)

使用亲和(定量)数据从多个ChIP-seq实验中计算差异绑定位点。还支持占用(重叠)分析和绘图功能。

作者:Rory Stark< Rory。Stark在cruk.cam.ac。Gord Brown

维护者:Rory Stark< Rory。Stark在cruk.cam.ac.uk>

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PDF	R脚本	DiffBind: ChIP-Seq峰值数据的差分绑定分析
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文本		新闻

细节

biocViews	ChIPSeq，DifferentialPeakCalling，测序，软件
版本	2.6.6
在Bioconductor	BioC 2.9 (R-2.14)(6.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 3.4)，GenomicRanges，SummarizedExperiment
进口	RColorBrewer，北极监测和评估方案，刨边机，gplotsgrDevices,limma，GenomicAlignments，locfit，统计，utils，IRanges，zlibbioc，晶格，systemPipeR、工具、Rcpp，dplyr，ggplot2，BiocParallel平行,S4Vectors，Rsamtools，DESeq2、方法、图形、ggrepel
链接	Rsamtools(> = 1.19.38),Rcpp
建议	DESeq，BiocStyle，testthat
SystemRequirements
增强了	rgl，XLConnect
URL
全靠我	ChIPQC，火神
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	DiffBind_2.6.6.tar.gz
Windows二进制	DiffBind_2.6.6.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	DiffBind_2.6.6.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/DiffBind
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/DiffBind/
软件包下载报告	下载数据
BioC 3.6的旧源包	源存档