DRIMSeq

DOI:10.18129 / B9.bioc.DRIMSeq

微分记录使用和tuQTL分析RNA-seq Dirichlet-multinomial模型

Bioconductor版本:版本(3.6)

包提供了两种框架。一个微分成绩单使用分析不同条件和一个用于tuQTL分析。两者都是基于基因组特征的数量(即建模。、成绩单)Dirichlet-multinomial分布。包也可用函数可视化和勘探的数据和结果。

作者:马格达雷娜Nowicka (aut (cre)

维护人员:马格达雷娜Nowicka < gosia。在uzh.ch nowicka >

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PDF	R脚本	微分记录使用和记录使用QTL分析与DRIMSeq RNA-seq包
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文本		新闻

细节

biocViews	AlternativeSplicing,DifferentialExpression,DifferentialSplicing,GeneExpression,遗传学,MultipleComparison,RNASeq,单核苷酸多态性,测序,软件,WorkflowStep
版本	1.6.0
Bioconductor自	BioC 3.3 (r - 3.3)(2年)
许可证	GPL (> = 3)
取决于	R (> = 3.4.0)
进口	跑龙套,统计数据,质量,GenomicRanges,IRanges,S4Vectors,BiocGenerics、方法、BiocParallel,limma,刨边机,ggplot2,reshape2
链接
建议	PasillaTranscriptExpr,GeuvadisTranscriptExpr、网格BiocStyle,knitr,testthat
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我	IsoformSwitchAnalyzeR
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	DRIMSeq_1.6.0.tar.gz
Windows二进制	DRIMSeq_1.6.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	DRIMSeq_1.6.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/DRIMSeq
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/DRIMSeq/
包下载报告	下载数据