DNACOPIGY

doi:10.18129/b9.bioc.dnacopy

DNA拷贝数数据分析

生物导体版本:版本(3.6)

实现循环二进制分割(CBS)算法以段DNA拷贝数数据,并识别具有异常拷贝数的基因组区域。

作者:Venkatraman E. Seshan,Adam Olshen

维护者:MSKCC.org>的Venkatraman E. Seshan

引用(从r内,输入引用(“ Dnacopy”)):

安装

要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ dnacopy”)

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Dnacopy”)

PDF R脚本 DNACOPIGY
PDF 参考手册

细节

生物浏览 库务,,,,微阵列,,,,软件
版本 1.52.0
在生物导体中 Bioc 1.6(R-2.1)或更早(> 13年)
执照 GPL(> = 2)
要看
进口
链接
建议
系统要求
增强
URL
取决于我 CGHCALL,,,,CGHMCR,,,,克隆性,,,,犯罪,,,,属属,,,,Snapcgh
进口我 adacgh2,,,,Aneufinder,,,,arraytv,,,,冠军,,,,CN.Farms,,,,cnanorm,,,,CNVRD2,,,,contibait,,,,Conumee,,,,copywriter,,,,Gwastools,,,,Medips,,,,最小值,,,,QDNASEQ,,,,RCGH,,,,repitools,,,,Snapcgh
建议我 Beadarraysnp,,,,CN. -ops,,,,fastseg,,,,Genoset
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 dnacopy_1.52.0.tar.gz
Windows二进制 dnacopy_1.52.0.zip(32-和64位)
Mac OS X 10.11(El Capitan) dnacopy_1.52.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/dnacopy
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/dnacopy/
软件包下载报告 下载统计

文档»

生物导体

r/克兰软件包和文档

支持»

请阅读发布指南。向以下位置之一发布有关生物导体的问题:

  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
  • 正常词 邮件列表 - 包装开发人员bob电竞体育官网