DMRforPairs

DOI:10.18129 / B9.bioc.DMRforPairs

DMRforPairs:使用基于甲基化轮廓的阵列识别独特样品之间的差异甲基化区域

Bioconductor版本:Release (3.6)

DMRforPairs(以前的DMR2+)允许研究人员比较n>=2个不同样本的甲基化情况。对n个单一样本的(成对)比较将DMRforPairs与其他现有管道区别开来，因为这些管道通常比较单个CpG位点或基于区域的分析中的样本组。DMRforPairs将感兴趣的区域定义为具有足够探针且彼此接近的基因组范围。一个区域中的探测可以选择性地标注到相同的函数类。差异甲基化是通过比较个体样本和(如果差异足够大)之间每个区域内的甲基化值来评估的，正式测试这种差异的统计显著性。

作者:Martin Rijlaarsdam [aut, cre]， Yvonne vd Zwan [aut]， Lambert Dorssers [aut]， Leendert Looijenga [aut]

维护者:Martin Rijlaarsdam

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PDF	R脚本	DMRforPairs_vignette
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细节

biocViews	注释，DNAMethylation，DifferentialMethylation，微阵列，ReportWriting，软件，可视化
版本	1.14.0
在Bioconductor	BioC 2.14 (R-3.1)(4年)
许可证	GPL (>= 2)
取决于	R (>= 2.15.2)，Gviz(> = 1.2.1),R2HTML(> = 2.2.1),GenomicRanges(>= 1.10.7)，平行
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源包	DMRforPairs_1.14.0.tar.gz
Windows二进制	DMRforPairs_1.14.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	DMRforPairs_1.14.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/DMRforPairs
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/DMRforPairs/
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