DMCHMM

DOI:10.18129 / B9.bioc.DMCHMM

基于隐马尔可夫模型的差异甲基化CpG

Bioconductor版本:Release (3.6)

DMCHMM是一种新型分析工具，用于在亚硫酸氢盐测序数据中使用隐马尔可夫模型识别差异甲基化CpG位点。

作者:Farhad Shokoohi

维护者:Farhad Shokoohi < Shokoohi at icloud.com>

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文档

超文本标记语言	R脚本	DMCHMM
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文本		新闻

细节

biocViews	报道，DifferentialMethylation，HiddenMarkovModel，测序，软件
版本	1.0.0
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 3.4.0)，SummarizedExperiment、方法、S4Vectors，BiocParallel，GenomicRanges，IRanges，fdrtool
进口	utils, stats, grDevices，rtracklayer，multcomp，校准、图形
链接
建议	testthat，knitr
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports	https://github.com/shokoohi/DMCHMM/issues
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包档案

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源包	DMCHMM_1.0.0.tar.gz
Windows二进制	DMCHMM_1.0.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	DMCHMM_1.0.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/DMCHMM
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/DMCHMM/
软件包下载报告	下载数据