CytoML

DOI:10.18129 / B9.bioc.CytoML

openCyto的GatingML接口

Bioconductor版本:Release (3.6)

该包采用GatingML2.0作为标准格式,用于与其他软件平台交换门控数据。

作者:Mike Jiang

维护者:Mike Jiang

引文(从R内,输入引用(“CytoML”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“巨细胞”)

文档

超文本标记语言 R脚本 如何导出一个GatingSet到GatingML
超文本标记语言 R脚本 如何将gatingML解析为GatingSet
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DataImportDataRepresentationFlowCytometry软件
版本 1.4.1
在Bioconductor BioC 3.4 (R-3.3)(1.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于
进口 flowCore(> = 1.43.10),flowWorkspace(> = 3.25.16),openCyto(> = 1.11.3),XMLdata.tableflowUtils(> = 1.35.7),jsonliteRBGLncdfFlowRgraphvizBiobase、方法、,图形,utils,base64encplyrggcyto(> = 1.5.4)
链接
建议 testthatflowWorkspaceData(> = 2.11.1),knitr
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 CytoML_1.4.1.tar.gz
Windows二进制 CytoML_1.4.1.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) CytoML_1.4.1.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CytoML
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/CytoML/
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