芝加哥

DOI:10.18129 / B9.bioc.Chicago

芝加哥:基因组组织捕获Hi-C分析

Bioconductor版本:Release (3.6)

用于分析Capture Hi-C数据的管道。

作者:Jonathan Cairns, Paula Freire Pritchett, Steven Wingett, Mikhail Spivakov

维护者:Mikhail Spivakov < Spivakov at babraham.ac.uk>

引文(从R内,输入引用(“芝加哥”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“芝加哥”)

文档

超文本标记语言 R脚本 芝加哥的故事
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文本 新闻

细节

biocViews 表观遗传学测序软件
版本 1.6.0
在Bioconductor BioC 3.3 (R-3.3)(2年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (>= 3.2),data.table
进口 matrixStats质量HmiscDelaporte,方法,grDevices,图形,统计,utils
链接
建议 argparseBiocStyleknitrrmarkdownPCHiCdatatestthatRsamtoolsGenomicInteractionsGenomicRangesIRangesAnnotationHub
SystemRequirements
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源包 Chicago_1.6.0.tar.gz
Windows二进制 Chicago_1.6.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) Chicago_1.6.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Chicago
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/Chicago/
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