Bioconductor版本:Release (3.6)
用于分析Capture Hi-C数据的管道。
作者:Jonathan Cairns, Paula Freire Pritchett, Steven Wingett, Mikhail Spivakov
维护者:Mikhail Spivakov < Spivakov at babraham.ac.uk>
引文(从R内,输入引用(“芝加哥”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“芝加哥”)
超文本标记语言 | R脚本 | 芝加哥的故事 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 表观遗传学,嗝,测序,软件 |
版本 | 1.6.0 |
在Bioconductor | BioC 3.3 (R-3.3)(2年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (>= 3.2),data.table |
进口 | matrixStats,质量,Hmisc,Delaporte,方法,grDevices,图形,统计,utils |
链接 | |
建议 | argparse,BiocStyle,knitr,rmarkdown,PCHiCdata,testthat,Rsamtools,GenomicInteractions,GenomicRanges,IRanges,AnnotationHub |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | PCHiCdata |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | Chicago_1.6.0.tar.gz |
Windows二进制 | Chicago_1.6.0.zip |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | Chicago_1.6.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Chicago |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/Chicago/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |