ChIPXpress

DOI:10.18129 / B9.bioc.ChIPXpress

ChIPXpress:增强目标基因转录因子识别从ChIP-seq ChIP-chip使用公开的基因表达谱数据

Bioconductor版本:版本(3.6)

ChIPXpress采取作为输入预测ChIPx TF结合基因数据和使用相应的基因表达谱数据库从NCBI地理下载排名TF绑定目标的基因最有可能功能特遣部队的目标。

作者:乔治·吴

维护人员:乔治·吴< georgetwu gmail.com >

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PDF	R脚本	ChIPXpress
PDF		参考手册

细节

biocViews	ChIPSeq,ChIPchip,软件
版本	1.22.0
Bioconductor自	BioC 2.11 (r - 2.15)(5.5年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (> = 2.10),ChIPXpressData
进口	Biobase,GEOquery,frma,affy,bigmemory,biganalytics
链接
建议	mouse4302frmavecs,mouse4302.db,mouse4302cdf,RUnit,BiocGenerics
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

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源包	ChIPXpress_1.22.0.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	ChIPXpress_1.22.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ChIPXpress
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/ChIPXpress/
包下载报告	下载数据
老BioC 3.6源码包	源存档