生物导体版本:版本(3.6)
chipseq数据的质量指标。
作者:汤姆·卡罗尔(Tom Carroll),韦·刘(Wei Liu)
维护者:tom carroll
引用(从r内,输入引用(“ chipqc”)
):
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##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ chipqc”)
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browsevignettes(“ chipqc”)
R脚本 | 用CHIPQ评估ChIP-Seq样品质量 | |
chipqcsamplereport.pdf | ||
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | chipseq,,,,QualityControl,,,,报告写作,,,,测序,,,,软件 |
版本 | 1.14.0 |
在生物导体中 | Bioc 2.14(R-3.1)(4年) |
执照 | GPL(> = 3) |
要看 | r(> = 3.0.0),GGPLOT2,,,,差异,,,,基因组机(> = 1.17.19) |
进口 | 生物基因(> = 0.11.3),S4VECTORS(> = 0.1.0),iranges(> = 1.99.17),rsamtools(> = 1.17.28),基因组签名(> = 1.1.16),chipseq(> = 1.12.0),gtools,,,,生物比较, 方法,RESHAPE2,,,,喷嘴.r1,,,,生物酶,grdevices,统计,utils,GenomicFeatures,,,,txdb.hsapiens.ucsc.hg19,,,,txdb.hsapiens.ucsc.hg18.nown,,,,txdb.mmusculus.ucsc.mm10.nowngene,,,,txdb.mmusculus.ucsc.mm9,,,,txdb.rnorvegicus.ucsc.rn4.ensgene,,,,txdb.celegans.ucsc.ce6.ensgene,,,,txdb.dmelanogaster.ucsc.dm3.ensgene |
链接 | |
建议 | 生物使用 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
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源包 | chipqc_1.14.0.tar.gz |
Windows二进制 | chipqc_1.14.0.zip |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | chipqc_1.14.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/chipqc |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/chipqc/ |
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