类别

DOI:10.18129 / B9.bioc.Category

类别分析

Bioconductor版本:Release (3.6)

用于执行类别(基因集富集)分析的工具集合。

作者:Robert Gentleman [aut]， Seth Falcon [ctb]， Deepayan Sarkar [ctb]， Robert Castelo [ctb]， Bioconductor Package Maintainer [cre]

维护者:Bioconductor Package维护者< Maintainer at Bioconductor .org>

安装

要安装这个包，启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“类别”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“类别”)

PDF	R脚本	使用分类分析微阵列数据
PDF	R脚本	以染色体带为分类
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	注释，去，GeneSetEnrichment，通路，软件
版本	2.44.0
在Bioconductor	BioC 1.6 (R-2.1)或更早(> 13年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	方法、stats4BiocGenerics，AnnotationDbi，Biobase，矩阵
进口	跑龙套,统计数据,图，RBGL，GSEABase，genefilter，注释，DBI
链接
建议	EBarrays，所有，Rgraphviz，RColorBrewer，xtable(> = 1.4 6),hgu95av2.db，KEGG.db，SNPchip，geneplotter，limma，晶格，RUnit，org.Sc.sgd.db，GOstats，GO.db
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我	GOstats，meshr，PCpheno
进口我	categoryCompare，cellHTS2，eisa，gCMAP，interactiveDisplay，PCpheno，phenoTest，ppiStats，RDAVIDWebService，ReportingTools
建议我	BiocCaseStudies，GSEAlm，miRLAB，MmPalateMiRNA，qpgraph，RnBeads
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	Category_2.44.0.tar.gz
Windows二进制	Category_2.44.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	Category_2.44.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Category
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/Category/
软件包下载报告	下载数据