CNVRD2

doi:10.18129/b9.bioc.cnvrd2

CNVRD2:一种基于读取深度的方法,用于检测和基因型复杂的公共拷贝数变体,从下一代测序数据中。

生物导体版本:版本(3.6)

CNVRD2使用下一代测序数据来测量多个样品的人类基因拷贝数,缩进SNPS标记拷贝数变体并检测拷贝数多态基因组区域。

作者:Hoang Tan Nguyen,Tony R Merriman和Mik Black

维护者:hoang tan nguyen

引用(从r内,输入引用(“ CNVRD2”)):

安装

要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ cnvrd2”)

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ cnvrd2”)

PDF R脚本 带有尼特尔的降价小插图
PDF 参考手册

细节

生物浏览 聚类。,,,,库务,,,,覆盖范围,,,,Linkagedisequilibrium,,,,SNP,,,,测序,,,,软件
版本 1.16.0
在生物导体中 Bioc 2.13(R-3.0)(4。5年)
执照 GPL-2
要看 r(> = 3.0.0),方法,变体, 平行,rjags,,,,GGPLOT2,,,,栅格
进口 DNACOPIGY,,,,iranges,,,,rsamtools
链接
建议 尼特
系统要求
增强
URL https://github.com/hoangtn/cnvrd2
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 cnvrd2_1.16.0.tar.gz
Windows二进制 cnvrd2_1.16.0.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) cnvrd2_1.16.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cnvrd2
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/cnvrd2/
软件包下载报告 下载统计

文档»

生物导体

r/克兰软件包和文档

支持»

请阅读发布指南。向以下位置之一发布有关生物导体的问题:

  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
  • 正常词 邮件列表 - 包装开发人员bob电竞体育官网