Bioconductor版本:版本(3.6)
大规模的识别和先进的可视化的守恒的非编码元素集。
作者:通用电气Tan < ge_tan live.com >
维护人员:通用电气Tan < ge_tan live.com >
从内部引用(R,回车引用(“cn”)
):
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“cn”)
HTML | R脚本 | CNE识别和可视化 |
HTML | R脚本 | 成对全基因组排列 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 | |
文本 | 许可证 |
biocViews | DataImport,GeneRegulation,软件,可视化 |
版本 | 1.14.0 |
Bioconductor自 | BioC 2.14 (r - 3.1)(4年) |
许可证 | GPL-2 |文件许可 |
取决于 | R (> = 3.4) |
进口 | Biostrings(> = 2.33.4),DBI(> = 0.7),RSQLite(> = 0.11.4),GenomeInfoDb(> = 1.1.3),GenomicRanges(> = 1.23.16),rtracklayer(> = 1.25.5),XVector(> = 0.5.4),GenomicAlignments(> = 1.1.9)、方法S4Vectors(> = 0.13.13),IRanges(> = 2.5.27),readr(> = 0.2.2),BiocGenerics、工具、平行reshape2(> = 1.4.1),ggplot2(> =魅惑,poweRlaw(> = 0.60.3),注释(> = 1.50.0),GO.db(> = 3.3.0),R.utils(> = tripwire),KEGGREST(> = 1.14.0) |
链接 | S4Vectors,IRanges,XVector |
建议 | Gviz(> = 1.7.4),BiocStyle,knitr,rmarkdown,testthat,BSgenome.Drerio.UCSC.danRer10,BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38,TxDb.Drerio.UCSC.danRer10.refGene,BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19,BSgenome.Ggallus.UCSC.galGal3 |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/ge11232002/CNEr |
BugReports | https://github.com/ge11232002/CNEr/issues |
取决于我 | |
进口我 | TFBSTools |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | CNEr_1.14.0.tar.gz |
Windows二进制 | CNEr_1.14.0.zip(32位和64位) |
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) | CNEr_1.14.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CNEr |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/CNEr/ |
包下载报告 | 下载数据 |