BiocParallel

DOI:10.18129 / B9.bioc.BiocParallel

用于并行评估的生物导体设备

Bioconductor版本:Release (3.6)

此包提供了用于并行计算的修改版本和新颖函数实现，为与Bioconductor对象一起使用而定制。

作者:Bioconductor Package Maintainer [cre]， Martin Morgan [aut]， Valerie Obenchain [aut]， Michel Lang [aut]， Ryan Thompson [aut]

维护者:Bioconductor Package维护者< Maintainer at Bioconductor .org>

安装

要安装这个包，启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“BiocParallel”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“BiocParallel”)

PDF	R脚本	1.BiocParallel简介
PDF	R脚本	2.错误，日志和调试
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	基础设施，软件
版本	1.12.0
在Bioconductor	BioC 2.13 (R-3.0)(4.5年)
许可证	Gpl-2 | gpl-3
取决于	方法
进口	属性,跑龙套,futile.logger平行,雪
链接	黑洞
建议	BiocGenerics、工具、foreach，BatchJobs，BBmisc，doParallel，Rmpi，GenomicRanges，RNAseqData.HNRNPC.bam.chr14，TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene，VariantAnnotation，Rsamtools，GenomicAlignments，ShortRead，codetools，RUnit，BiocStyle，knitr
SystemRequirements	c++ 11
增强了
URL	https://github.com/Bioconductor/BiocParallel
BugReports	https://github.com/Bioconductor/BiocParallel/issues
全靠我	培根，ClassifyR，clusterSeq，consensusSeekeR，文案，csaw，cydar，DEXSeq，DMCHMM，doppelgangR，GenomicFiles，hiReadsProcessor，检查，工商管理硕士，metagene，MSnbase，Oscope，PCAN，pRoloc，Rqc，食物，ShortRead，SigCheck，STROMA4，股东价值分析，xcms
进口我	ALDEx2，amplican，BioCor，biotmle，cellbaseR，ChIPexoQual，ChIPQC，chromswitch，chromVAR，contiBAIT，coseq，cpvSNP，CRISPRseek，CrispRVariants，dcGSA，derfinder，DESeq2，DiffBind，剂量，DRIMSeq，easyRNASeq，EMDomics，fgsea，FindMyFriends，flowcatchR，GenoGAM，GenomicAlignments，genotypeeval，gmapR，GUIDEseq，h5vc，HiCcompare，HTSeqGenie，HTSFilter，理想的，IHWpaper，ima，ImpulseDE2，InPAS，感兴趣，电离，首次公开募股，iva，JunctionSeq，LowMACA，MCbiclust，metabomxtr，MethylAid，methylInheritance，methyvim，MIGSA，motifbreakR，Pbase，pbcmc，proFIA，QDNAseq，qpgraph，qsea，QuasR，重新计票，REMP，RJMCMCNucleosomes，Rsamtools，RUVcorr，scDD，scde，SCnorm，司康饼，scoreInvHap，SNPhood，soGGi，飞溅，TarSeqQC，TFBSTools，TMixClust，trena，TSRchitect，TVTB，Uniquorn，VariantFiltering，VariantTools，zinbwave
建议我	嵌合体，curatedMetagenomicData，erma，MethylAidData，oneChannelGUI，SeqArray，systemPipeR，tofsims
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	BiocParallel_1.12.0.tar.gz
Windows二进制	BiocParallel_1.12.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	BiocParallel_1.12.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/BiocParallel
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/BiocParallel/
软件包下载报告	下载数据