BGEEDB

doi:10.18129/b9.bioc.bgeedb

从BGEE数据库检索注释和基因表达数据

生物导体版本:版本(3.6)

从BGEE数据库中下载注释和基因表达数据的软件包,以及TopAnat分析:通过表达模式映射到基因的解剖学术语的GO样富集。

作者:Andrea Komljenovic [AUT,CRE],Julien Roux [AUT,CRE]

维护人员:朱利安·沃尔布雷特(Julien Wollbrett

引用(从r内,输入引用(“ BGEEDB”)):

安装

要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ bgeedb”)

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文本 消息

细节

生物浏览 DataImport,,,,,,,,基因表达,,,,基因烯,,,,微阵列,,,,测序,,,,软件
版本 2.5.0
在生物导体中 Bioc 3.3(R-3.3)(2年)
执照 GPL-2
要看 r(> = 3.3.0),topgo,,,,花花公子
进口 Data.Table,,,,rcurl,,,,消化,方法,统计,utils,dplyr,,,,图形,,,,生物酶
链接
建议 尼特,,,,生物使用,,,,测试,,,,rmarkDown
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我 psygenet2r,,,,丽塔
建议我
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跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 bgeedb_2.5.0.tar.gz
Windows二进制 bgeedb_2.5.0.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) bgeedb_2.5.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/bgeedb
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/bgeedb/
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