BPRMeth

DOI:10.18129 / B9.bioc.BPRMeth

建模高阶甲基化剖面

Bioconductor版本:Release (3.6)

BPRMeth包使用二项式Probit回归似然来模拟甲基化剖面并提取高阶特征。这些特征精确地定量了甲基化剖面形状的概念。利用这些跨启动子-近端区域的高阶特征，我们构建了一个强大的基因表达预测器。此外，这些特征被用来聚类近端启动子区域使用EM算法。

作者:Chantriolnt-Andreas Kapourani [aut, cre]

维护者:Chantriolnt-Andreas Kapourani

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PDF	R脚本	BPR方法介绍
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文本		新闻

细节

biocViews	贝叶斯，聚类，报道，DNAMethylation，表观遗传学，FeatureExtraction，GeneExpression，GeneRegulation，遗传学，KEGG，RNASeq，回归，测序，软件
版本	1.4.0
在Bioconductor	BioC 3.4 (R-3.3)(1.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 3.3.0)，GenomicRanges
进口	为了、方法、质量，doParallel平行,e1071，地球，foreach，randomForest统计数据,IRanges，S4Vectors，data.table、图形
链接
建议	testthat，knitr，rmarkdown，BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

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源包	BPRMeth_1.4.0.tar.gz
Windows二进制	BPRMeth_1.4.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	BPRMeth_1.4.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/BPRMeth
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/BPRMeth/
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