基本

doi：10.18129/b9.bioc.basics

单细胞测序数据的贝叶斯分析

生物导体版本：版本（3.6）

单细胞mRNA测序可以在看似均匀的细胞种群中发现基因表达水平的新细胞对细胞异质性。但是，这些实验容易出现高水平的技术噪声，为识别在研究细胞种群中表现出真正异质表达的基因带来了新的挑战。基础知识（单细胞测序数据的贝叶斯分析）是一种集成的贝叶斯分层模型，可在有监督的实验的背景下对单细胞RNA测序数据集进行统计分析（其中感兴趣的细胞群是先验的，例如实验条件，例如实验条件。或单元格类型）。基础知识执行内置数据归一化（全局缩放）和技术噪声量化（基于尖峰基因）。基础知识提供了一组细胞内高度（或低）可变基因的直观检测标准。另外，基础可以比较两个或多个预先指定的细胞组之间的基因表达模式。与传统的差异表达工具不同，基础知识量化了超出平均值比较的表达变化，还可以研究细胞对细胞异质性的变化。通过生物过度分散参数来量化后者，该参数在归一化和技术噪声去除后测量残留过度分散（相对于泊松采样）。

作者：Catalina Vallejos [AUT，CRE]，Nils Eling [AUT]，Sylvia Richardson [CTB]，John Marioni [CTB]

维护者：Catalina A. Vallejos

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生物浏览	贝叶斯，，，，细胞生物学，，，，差异性，，，，基因表达，，，，正常化，，，，rnaseq，，，，测序，，，，Singlecell，，，，软件，，，，转录组学
版本	1.0.1
执照	GPL（> = 2）
要看	r（> = 3.4），Singlecellexperiment
进口	总结性特征，，，，S4VECTORS，，，，生物基因，，，，RCPP（> = 0.11.3），方法，结尾，，，，斯克兰，，，，测试，，，，Data.Table，，，，矩阵，图形，克恩斯门茶，grdevices，统计，utils
链接	RCPP，，，，rcpparmadillo
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