ArrayExpressHTS

DOI:10.18129 / B9.bioc.ArrayExpressHTS

ArrayExpress高通量测序处理流水线

Bioconductor版本:Release (3.6)

用于公共ArrayExpress实验或本地数据集的RNA-Seq处理管道

作者:Angela Goncalves, Andrew Tikhonov

维护者:Angela Goncalves

安装

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文档

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PDF	R脚本	ArrayExpressHTS: RNA-Seq管道转录分析实验
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	RNASeq，测序，软件
版本	1.28.0
在Bioconductor	BioC 2.8 (R-2.13)(7年)
许可证	艺术许可2.0
取决于	抽样，Rsamtools(> = 1.19.36),雪
进口	Biobase，BiocGenerics，Biostrings，DESeq，GenomicRanges，Hmisc，IRanges，R2HTML，RColorBrewer，Rsamtools，ShortRead，XML，biomaRt，刨边机， grDevices，图形，方法，rJava统计数据,svMisc跑龙套,sendmailR，bitops
链接	Rsamtools
建议
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增强了
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构建报告

包档案

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源包	ArrayExpressHTS_1.28.0.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	ArrayExpressHTS_1.28.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ArrayExpressHTS
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/ArrayExpressHTS/
软件包下载报告	下载数据