ArrayExpressHTS

DOI:10.18129 / B9.bioc.ArrayExpressHTS

ArrayExpress高通量测序处理流水线

Bioconductor版本:Release (3.6)

用于公共ArrayExpress实验或本地数据集的RNA-Seq处理管道

作者:Angela Goncalves, Andrew Tikhonov

维护者:Angela Goncalves

引文(从R内,输入引用(“ArrayExpressHTS”)):

安装

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##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“ArrayExpressHTS”)

文档

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browseVignettes(“ArrayExpressHTS”)

PDF R脚本 ArrayExpressHTS: RNA-Seq管道转录分析实验
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews RNASeq测序软件
版本 1.28.0
在Bioconductor BioC 2.8 (R-2.13)(7年)
许可证 艺术许可2.0
取决于 抽样Rsamtools(> = 1.19.36),
进口 BiobaseBiocGenericsBiostringsDESeqGenomicRangesHmiscIRangesR2HTMLRColorBrewerRsamtoolsShortReadXMLbiomaRt刨边机, grDevices,图形,方法,rJava统计数据,svMisc跑龙套,sendmailRbitops
链接 Rsamtools
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源包 ArrayExpressHTS_1.28.0.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.11 (El Capitan) ArrayExpressHTS_1.28.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ArrayExpressHTS
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/ArrayExpressHTS/
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