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- Bioconductor 3.6
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- AnnotationHubData
AnnotationHubData
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DOI:10.18129 / B9.bioc.AnnotationHubData
公共数据资源转换成Bioconductor数据结构
Bioconductor版本:版本(3.6)
这些食谱将各种和越来越多的公共科学数据集轻松使用标准Bioconductor数据结构。
作者:马丁•摩根(施)马克·卡尔森(施),丹特南鲍姆(施),Sonali Arora[所有],保罗•香农(施)Bioconductor包维护者(cre)
维修工:Bioconductor包维护者<维护者bioconductor.org >
从内部引用(R,回车引用(“AnnotationHubData”)):
安装
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“AnnotationHubData”)
文档
| HTML | 介绍AnnotationHubData | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | DataImport,软件 |
| 版本 | 1.8.1 |
| Bioconductor自 | BioC 3.2 (r - 3.2)(2.5年) |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | R(> = 3.2.2)、方法、效用,S4Vectors(> = 0.7.21),IRanges(> = 2.3.23),GenomicRanges,AnnotationHub(> = 2.9.14) |
| 进口 | GenomicFeatures,Rsamtools,rtracklayer,BiocGenerics,jsonlite,BiocInstaller,biocViews,AnnotationDbi,Biobase,Biostrings,DBI,GEOquery,GenomeInfoDb,OrganismDbi,RSQLite,rBiopaxParser,AnnotationForge,futile.logger(1.3.0 > =版本),XML,RCurl |
| 链接 | |
| 建议 | RUnit,knitr,BiocStyle,grasp2db,BiocInstaller |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | ExperimentHubData,ProteomicsAnnotationHubData |
| 进口我 | AHEnsDbs |
| 建议我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | AnnotationHubData_1.8.1.tar.gz |
| Windows二进制 | AnnotationHubData_1.8.1.zip |
| Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) | AnnotationHubData_1.8.1.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/AnnotationHubData |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/AnnotationHubData/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
| 老BioC 3.6源码包 | 源存档 |
