生物导体版本:版本(3.6)
该软件包实现了来自全基因组单细胞测序数据的CNV调用,绘制,导出和分析的功能。
作者:Aaron Taudt,Bjorn Bakker,David Porubsky
维护者:aaron taudt
引用(从r内,输入引用(“ Aneufinder”)
):
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##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ aneufinder”)
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R脚本 | 快速介绍Aneufinder | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 库务,,,,基因组变量,,,,HiddenMarkovModel,,,,软件,,,,全媒体 |
版本 | 1.6.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.3(R-3.3)(2年) |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | r(> = 3.3),基因组机,,,,牛仔图,,,,Aneufinderdata |
进口 | 方法,UTILS,GRDEVICES,图形,统计信息,foreach,,,,多帕尔,,,,生物基因,,,,S4VECTORS,,,,GenomeInfodB,,,,iranges,,,,rsamtools,,,,bamsignals,,,,DNACOPIGY,,,,生物弦,,,,基因组签名,,,,GGPLOT2,,,,RESHAPE2,,,,ggdendro,,,,Ggrepel,,,,重新排序,,,,mclust |
链接 | |
建议 | 尼特,,,,生物使用,,,,测试,,,,bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19,,,,bsgenome.mmusculus.ucsc.mm10 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | https://github.com/ataudt/aneufinder.git |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | Aneufinder_1.6.0.tar.gz |
Windows二进制 | aneufinder_1.6.0.zip(32-和64位) |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | Aneufinder_1.6.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/aneufinder |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/aneufinder/ |
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