ACME

DOI:10.18129 / B9.bioc.ACME

计算微阵列富集(ACME)算法

Bioconductor版本:Release (3.6)

ACME(算法计算微阵列富集)是一套工具,用于分析平片阵列ChIP/ ChIP, DNAse超敏反应,或其他导致基因组区域显示“富集”的实验。它不依赖于特定的阵列技术(尽管阵列应该是一个“平铺”阵列),非常通用(可以应用于导致富集区域的实验),并且对阵列噪声或归一化方法非常不敏感。它的运算速度非常快,在有足够内存的情况下,可以很容易地应用于全基因组平铺阵列实验。

作者:Sean Davis

维护者:Sean Davis

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PDF R脚本 ACME
PDF 参考手册

细节

biocViews 微阵列归一化软件技术
版本 2.34.0
在Bioconductor BioC 2.0 (R-2.5)(11年)
许可证 GPL (>= 2)
取决于 R (>= 2.10),Biobase(>= 2.5.5),方法BiocGenerics
进口 图形、统计数据
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URL http://watson.nci.nih.gov/~sdavis
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源包 ACME_2.34.0.tar.gz
Windows二进制 ACME_2.34.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan) ACME_2.34.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ACME
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/ACME/
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