Bioconductor版本:Release (3.6)
ACME(算法计算微阵列富集)是一套工具,用于分析平片阵列ChIP/ ChIP, DNAse超敏反应,或其他导致基因组区域显示“富集”的实验。它不依赖于特定的阵列技术(尽管阵列应该是一个“平铺”阵列),非常通用(可以应用于导致富集区域的实验),并且对阵列噪声或归一化方法非常不敏感。它的运算速度非常快,在有足够内存的情况下,可以很容易地应用于全基因组平铺阵列实验。
作者:Sean Davis
维护者:Sean Davis
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R脚本 | ACME | |
参考手册 |
biocViews | 微阵列,归一化,软件,技术 |
版本 | 2.34.0 |
在Bioconductor | BioC 2.0 (R-2.5)(11年) |
许可证 | GPL (>= 2) |
取决于 | R (>= 2.10),Biobase(>= 2.5.5),方法BiocGenerics |
进口 | 图形、统计数据 |
链接 | |
建议 | |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | http://watson.nci.nih.gov/~sdavis |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | 益生元 |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | ACME_2.34.0.tar.gz |
Windows二进制 | ACME_2.34.0.zip(32位和64位) |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | ACME_2.34.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ACME |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/ACME/ |
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