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DOI:10.18129 / B9.bioc.curatedMetagenomicData

人类微生物组的策划宏基因组数据

Bioconductor版本:版本(3.5)

curatedMetagenomicData包提供微生物分类、功能以及基因标记样本收集来自不同bodysites丰富。

作者:卢卡斯希弗<希弗。卢卡斯在gmail.com >,Edoardo Pasolli , Levi Waldron , Faizan Malik , Nicola Segata , Valerie Obenchain , Morgan Martin

维护人员:卢卡斯希弗<希弗。卢卡斯在gmail.com >

安装

安装这个包,开始R和输入:

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文档

HTML	R脚本	curatedMetagenomicData
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	ExperimentData,Homo_sapiens_Data,MicrobiomeData,ReproducibleResearch
版本	1.2.2
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 3.3.0),dplyr(> = 0.5.0),phyloseq(> = 1.18.0),Biobase(> = 2.34.0),ExperimentHub(> = 1.0.0),AnnotationHub(> = 2.6.0),magrittr
进口	BiocInstaller跑龙套,tidyr,metagenomeSeq
链接
建议	devtools,roxygen2,testthat,covr,knitr,rmarkdown,BiocCheck,BiocStyle,BiocInstaller,BiocParallel,readr,RISmed,ggplot2
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/waldronlab/curatedMetagenomicData
BugReports	https://github.com/waldronlab/curatedMetagenomicData/issues
取决于我
进口我
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包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	curatedMetagenomicData_1.2.2.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/curatedMetagenomicData
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/curatedMetagenomicData/
包下载报告	下载数据