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DOI:10.18129 / B9.bioc.RforProteomics

伙伴计划的“蛋白质组学数据分析使用R和Bioconductor”出版

Bioconductor版本:版本(3.5)

这个包包含代码演示了使用R和Bioconductor蛋白质组学数据分析的论文。两个小片断描述所需的代码和数据复制本文中描述的示例和数据和功能蛋白质组学可视化。

作者:Laurent与(aut (cre)托马斯·林皮德森[所有],塞巴斯蒂安·吉布(施),弗拉德Petyuk(施)

维修工:Laurent与< lg390在cam.ac.uk >

安装

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文档

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browseVignettes (“RforProteomics”)

PDF	R脚本	当前视角使用R和Bioconductor蛋白质组学数据分析
PDF	R脚本	RforProteomics Bioc2013海报
PDF	R脚本	为蛋白质组学数据分析使用R
HTML		使用R和Bioconductor蛋白质组学数据的可视化
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	ExperimentData,MassSpectrometryData,ReproducibleResearch
版本	1.14.0
许可证	艺术- 2.0
取决于	MSnbase
进口	R.utils,Biobase,rpx,biocViews,BiocInstaller,interactiveDisplay,闪亮的
链接
建议	knitr,rmarkdown,BiocStyle,mzR,xcms,msdata,等压线,MALDIquant(> = 1.12),MALDIquantForeign,readBrukerFlexData,rTANDEM,synapter,synapterdata,IPPD,Rdisop,OrgMassSpecR,大脑,的方式,hpar,GO.db,org.Hs.eg.db,biomaRt,RColorBrewer,ggplot2,reshape2,xtable,晶格,mzID,pRoloc,pRolocdata,MSGFplus,MSGFgui,MSnID,msmsTests,msmsEDA,corrplot,Heatplus,gplots,维恩图,genefilter
SystemRequirements
增强了	切肉刀
URL	http://lgatto.github.com/RforProteomics/
取决于我
进口我
建议我	proteoQC,qcmetrics
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	RforProteomics_1.14.0.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RforProteomics
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/RforProteomics/
包下载报告	下载数据