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DOI:10.18129 / B9.bioc.XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh38

智人的额外SNP位点(dbSNP Build 144)

Bioconductor版本:Release (3.5)

从NCBI dbSNP Build 144中提取的额外的智人SNP位点和等位基因。该包使用的源数据文件由NCBI于2015年5月30日创建，包含参考基因组GRCh38的snp。p2 (GRCh38的修补版本，不会改变染色体1-22,X, Y, MT)。而SNPlocs.Hsapiens.dbSNP144。GRCh38包只包含“snp”类的分子变异，该包包含其他类别的分子变异(in-del、杂合、微卫星、命名位点、无变异、混合和多核苷酸多态性)。

作者:Herve Pages

维护者:H. Pages

安装

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文档

PDF		参考手册

细节

biocViews	AnnotationData，遗传学，Homo_sapiens，XtraSNPlocs
版本	0.99.12
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 2.10)，BSgenome
进口	方法,跑龙套,BiocGenerics，S4Vectors，IRanges，GenomeInfoDb，GenomicRanges，BSgenome
链接
建议	Biostrings，BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38，SNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh38
SystemRequirements
增强了
URL
这取决于我
进口我
建议我	BSgenome

包档案

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源包	XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh38_0.99.12.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.11 (El Capitan)
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh38/
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