要安装此软件包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// URL(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ snplocs.hsapiens.dbsnp.20101109”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。
生物导体版本:版本(3.5)
从NCBI DBSNP构建中提取的HOMO SAPIENS的SNP位置和等位基因132.该软件包使用的源数据文件是由NCBI于2010年11月9日创建的,包含映射到参考基因组GRCH37的SNP。警告:请注意,除线粒体染色体外,GRCH37基因组与UCSC的HG19基因组相同。因此,该软件包中的SNP可以“注入” bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19中,但是该注入将排除CHRM(即,该序列中不会注入任何内容)。
作者:Herve页面
维护者:H。页面
引用(从r内,输入引用(“ snplocs.hsapiens.dbsnp.20101109”)
):
要安装此软件包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// URL(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ snplocs.hsapiens.dbsnp.20101109”)
参考手册 |
生物浏览 | AnnotationData,,,,遗传学,,,,homo_sapiens |
版本 | 0.99.7 |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | r(> = 2.10),iranges,,,,基因组机 |
进口 | 方法,S4VECTORS,,,,iranges,,,,基因组机 |
链接 | |
建议 | 生物弦,,,,BSGENOME(> = 1.16.1),bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | ceu1kg,,,,变体 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | snplocs.hsapiens.dbsnp.20101109_0.99.7.tar.gz |
Windows二进制 | |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/snplocs.hsapiens.dbsnp.20101109/ |
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