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BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38.masked

DOI:10.18129 / B9.bioc.BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38.masked

完整的蒙面基因组序列智人(hg38 UCSC的版本)

Bioconductor版本:版本(3.5)

完整的基因组序列智人(人类)提供的UCSC (hg38, 2013年12月)和存储在Biostrings对象。BSgenome.Hsapiens.UCSC序列是一样的。hg38,除了他们每个人上面具后的4:(1)装配间隙的面具(AGAPS面具),(2)的面具intra-contig模棱两可(AMB面具),(3)重复的面具RepeatMasker (RM面具),和(4)串联重复序列的重复的面具仪(扶轮基金会面具)。只有AGAPS和AMB面具默认是“活跃”的。

作者:Bioconductor Dev团队

维修工:Bioconductor包维护者<维护者bioconductor.org >

从内部引用(R,回车引用(“BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38.masked”)):

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文档

PDF 参考手册

细节

biocViews AnnotationData,BSgenome,遗传学,Homo_sapiens
版本 1.3.99
许可证 艺术- 2.0
取决于 BSgenome(> = 1.35.17),BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38
进口 BSgenome,BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38
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源包 BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38.masked_1.3.99.tar.gz
Windows二进制
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