# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19”)

DOI:10.18129 / B9.bioc.BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19

完整的基因组序列智人(hg19 UCSC的版本)

Bioconductor版本:版本(3.5)

完整的基因组序列智人(人类)提供的UCSC (hg19, 2009年2月)和存储在Biostrings对象。

作者:Bioconductor Dev团队

维修工:Bioconductor包维护者<维护者bioconductor.org >

安装

安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19”)

文档

PDF		参考手册

细节

biocViews	AnnotationData,BSgenome,遗传学,Homo_sapiens
版本	1.4.0
许可证	艺术- 2.0
取决于	BSgenome(> = 1.33.5)
进口	BSgenome
链接
建议	TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19.masked,嵌合体,食典委,motifRG,tra利用
进口我	BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19.masked,ChIPComp,MADSEQ,RareVariantVis,美国广播公司,REMP
建议我	AneuFinder,ArrayTV,ATACseqQC,BadRegionFinder,Basic4Cseq,BBCAnalyzer,biovizBase,ChIPpeakAnno,cn,CRISPRseek,customProDB,DNAshapeR,ensembldb,FDb.FANTOM4.promoters.hg19,FDb.UCSC.snp135common.hg19,FDb.UCSC.snp137common.hg19,gcapc,GenomicAlignments,GenomicFeatures,GenomicRanges,GenomicScores,GenVisR,ggbio,gmapR,GoogleGenomics,GUIDEseq,Gviz,h5vc,InPAS,感兴趣,karyoploteR,MEDIPS,MinimumDistance,海市蜃楼,motifbreakR,MutationalPatterns,oneChannelGUI,OrganismDbi,PGA,qsea,R453Plus1Toolbox,ramwas,Rariant,rGADEM,RiboProfiling,Rsamtools,RSVSim,rtracklayer,SGSeq,签名者,SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20101109,SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20120608,SNPlocs.Hsapiens.dbSNP142.GRCh37,SNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh37,连接工具,VariantAnnotation,wavClusteR,XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh37,YAPSA

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19_1.4.0.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19/
包下载报告	下载数据