要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
Bioconductor版本:Release (3.5)
智人(人类)的完整基因组序列由UCSC提供(hg18, 2006年3月)并存储在Biostrings对象中。
作者:Bioconductor开发团队
维护者:Bioconductor Package维护者< Maintainer at Bioconductor .org>
引文(从R内,输入引用(“BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18”)
参考手册 |
biocViews | AnnotationData,BSgenome,遗传学,Homo_sapiens |
版本 | 1.3.1000 |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | BSgenome(> = 1.33.5) |
进口 | BSgenome |
链接 | |
建议 | TxDb.Hsapiens.UCSC.hg18.knownGene |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18.masked |
进口我 | BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18.masked,VanillaICE |
建议我 | ArrayTV,Biostrings,魅力,ListerEtAlBSseq,MEDME,methylPipe,MethylSeekR,MinimumDistance,益生元,Repitools |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18_1.3.1000.tar.gz |
Windows二进制 | |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |