要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18

DOI:10.18129 / B9.bioc.BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18

智人全基因组序列(UCSC版本hg18)

Bioconductor版本:Release (3.5)

智人(人类)的完整基因组序列由UCSC提供(hg18, 2006年3月)并存储在Biostrings对象中。

作者:Bioconductor开发团队

维护者:Bioconductor Package维护者< Maintainer at Bioconductor .org>

引文(从R内,输入引用(“BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18”)

文档

PDF 参考手册

细节

biocViews AnnotationDataBSgenome遗传学Homo_sapiens
版本 1.3.1000
许可证 艺术- 2.0
取决于 BSgenome(> = 1.33.5)
进口 BSgenome
链接
建议 TxDb.Hsapiens.UCSC.hg18.knownGene
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我 BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18.masked
进口我 BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18.maskedVanillaICE
建议我 ArrayTVBiostrings魅力ListerEtAlBSseqMEDMEmethylPipeMethylSeekRMinimumDistance益生元Repitools

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18_1.3.1000.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.11 (El Capitan)
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18/
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