affylmGUI是Affymetrix微阵列数据的图形用户界面进行分析,使用戈登•史密斯的limma包(微阵列数据的线性模式)。limma和affylmGUI都是R包。的limma包R命令行界面用户提供最先进的技术的线性模型和识别差异表达基因微阵列数据。affylmGUI包,而不像limma强大的专家用户,提供了一个简单的指向和点击的界面的许多常用limma和affy功能。使用affylmGUI包,你需要R 1.8.1或稍后,Tcl / Tk 8.3或更高版本(ActiveTcl Windows / Linux或芬克的Tcl / Tk MacOSX (X11))和limma、affylmGUI tkrplot R包。affyPLM (Bioconductor), R2HTML(凹口)和xtable(凹口)包推荐。的limma和affyPLM包上可用Bioconductor,affylmGUI包是可用的在这里,另一个包是可用的凹口。affylmGUI已经成功测试了在Windows 2000, Windows XP, Red Hat Linux, Mac OSX和X11。
