# #——风格,回声= FALSE,结果= '飞机 '------------------------------- BiocStyle:减价 () ## ---- 图书馆,消息= FALSE ---------------------------------------------- 库(AnnotationHub) # #——AnnotationHub ------------------------------------------------------- 啊= AnnotationHub () ## ---- 显示 ---------------------------------------------------------------- 啊# #——dataprovider -------------------------------------------------------- 独特的(啊dataprovider美元)# #——物种 ------------------------------------------------------------- (独特的物种(啊)# #——rdataclass ---------------------------------------------------------- (独特的(啊rdataclass美元 )) ## ---- dm1 ----------------------------------------------------------------- dm < -查询(啊,c(“ChainFile”、“UCSC的”,“黑腹果蝇”))dm # #——show2 --------------------------------------------------------------- df < - mcols (dm) # #——长度 -------------------------------------------------------------- 长度(啊)# #——子集 -------------------------------------------------------------- 唯有通过< -查询(啊,c(“inparanoid8”、“ailuropoda”)已经有# #——显示,eval = FALSE ------------------------------------------------- # d < -显示器(啊)# #——dm2 ----------------------------------------------------------------- dm dm(“AH15146 "] ## ---- dm3 ----------------------------------------------------------------- dm AH15146[[” "]] ## ---- 示2 -------------------------------------------------------------- 啊# #——快照 ------------------------------------------------------------ snapshotDate(啊)# #——possibleDates ------------------------------------------------------- pd < - possibleDates(啊)pd # #设置当前日期,eval = FALSE ------------------------------------------------- # snapshotDate(啊)< - pd[1] # #——clusterOptions1 eval = FALSE ----------------------------------------- # 库(AnnotationHub) #中心< - AnnotationHub () # gr < -中心[[“AH50773”]]# #下载一次# txdb <——makeTxDbFromGRanges (gr) # #构建动态# #——clusterOptions2,eval = FALSE ----------------------------------------- # 库(AnnotationDbi) # #如果尚未加载# txdb < - loadDb(“/ locationToFile / mytxdb.sqlite ") ## ---- sessionInfo --------------------------------------------------------- sessionInfo ()