# #——风格,eval = TRUE,呼应= FALSE,结果=“黑名单”- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - BiocStyle::乳胶()# #——FileDemo - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -库(RSQLite)库(AnnotationForge) read.table(系统。文件(“extdata”、“hcg110_ID”、包=“AnnotationDbi”), 9 =“t \”,标题= FALSE。= TRUE) [1:5] # #——availableDB0s - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - available.db0pkgs () # #——GetIntermedDB, eval = FALSE - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - #源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) # biocLite (human.db0) # #——checkforhumandb0,回声= FALSE - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -要求(“human.db0”) # #——GetOrg。db, eval = FALSE - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - # biocLite (“org.Hs.eg.db”) # #——列表模式- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - available.dbschemas () # #——SQLForge,整洁= FALSE,结果=“隐藏”- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - hcg110_IDs =系统。文件(“extdata”、“hcg110_ID”、包=“AnnotationDbi”) tmpout = tempdir () makeDBPackage (affy = FALSE,“HUMANCHIP_DB”=“hcg110”前缀,文件名= hcg110_IDs baseMapType =“g”, outputDir = tmpout version = " 1.0.0 ",制造商=“Affymetrix chipName =“人类癌症危数组”,manufacturerUrl = " http://www.affymetrix.com ") # #——cleanup2,回声= FALSE,结果=“隐藏”- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - file.remove(文件。路径(tmpout hcg110.sqlite)) file.rename(文件。路径(tmpout hcg110.db),文件。路径(tmpout foo.db)) # #——安装、eval = FALSE - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - #安装。包(“packageNameAndPath回购= NULL,类型=“源”)# #——createSimpleMapping,整洁= FALSE - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -库(hgu95av2.db) hgu95av2NAMESYMBOL < - createSimpleBimap (“gene_info”、“gene_name”,“象征”,hgu95av2。加上了datacache db:::,“NAMESYMBOL”,“hgu95av2.db”) # #映射我们做什么?hgu95av2NAMESYMBOL # #显示1 4关系在这个新的映射as.list (hgu95av2NAMESYMBOL) [1:4] # #——SessionInfo,回声= FALSE - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - SessionInfo ()