##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("wiggleplotr")

DOI:10.18129 / B9.bioc.wiggleplotr

从BigWig文件制作读覆盖率图

Bioconductor版本:Release (3.5)

从测序实验和基因组注释(基因，转录本，峰值)中可视化读覆盖的工具。长转录本的内含子可以缩放到固定长度，以便更好地可视化外显子读覆盖。

作者:Kaur Alasoo [au, cre]

维护者:Kaur Alasoo < Kaur。同样在gmail.com>

安装

要安装这个包，开始R，然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("wiggleplotr")

文档

超文本标记语言	R脚本	介绍wiggleplotr
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	AlternativeSplicing，ChIPSeq，报道，GeneExpression，RNASeq，测序，软件，转录，可视化
版本	1.0.0
在Bioconductor公司	BioC 3.5 (R-3.4)(0.5年)
许可证	Apache License 2.0
取决于	R (>= 3.4)
进口	dplyr，ggplot2(> = 2.2.0),GenomicRanges，rtracklayer，cowplot，为了，purrr，S4Vectors，IRanges，GenomeInfoDb
链接
建议	knitr，rmarkdown，biomaRt，GenomicFeatures，testthat，ensembldb，EnsDb.Hsapiens.v86，org.Hs.eg.db，TxDb.Hsapiens.UCSC.hg38.knownGene，AnnotationDbi，AnnotationFilter
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包	wiggleplotr_1.0.0.tar.gz
Windows二进制	wiggleplotr_1.0.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	wiggleplotr_1.0.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/wiggleplotr
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/wiggleplotr/
软件包下载报告	下载数据