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DOI:10.18129 / B9.bioc.wavClusteR

敏感和高度解决识别PAR-CLIP rna蛋白质交互网站的数据

Bioconductor版本:版本(3.5)

包提供了一个集成管道PAR-CLIP数据的分析。PAR-CLIP-induced转换首先从测序错误,歧视SNPs和额外的非实验来源的非参数混合模型。蛋白质结合位点(集群)然后解决在高分辨率和集群使用严格的统计估计贝叶斯框架。后处理的结果,数据导出UCSC基因组浏览器可视化和主题搜索分析。此外,该计划允许集成RNA-Seq数据估计集群的错误发现率检测。关键功能支持并行多核计算。注意:虽然PAR-CLIP wavClusteR设计数据分析,它可以被应用到其他门店数据分析中得到了实验过程,从而诱导核苷酸替换(例如BisSeq)。

作者:费德里科•斯文Comoglio和杰姆

维护人员:费德里科•Comoglio < federico.comoglio gmail.com >