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variancePartition
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DOI:10.18129 / B9.bioc.variancePartition
量化和解释潜水员多层次基因表达变化的实验
Bioconductor版本:版本(3.5)
量化和解释多个源生物技术基因表达变化的实验。利用线性混合模型来量化基因表达的变化归因于个人,组织,时间点,或技术变量。
作者:加布里埃尔·e·霍夫曼
维护人员:加布里埃尔·e·霍夫曼<加布里埃尔。霍夫曼在mssm.edu >
从内部引用(R,回车引用(“variancePartition”)):
安装
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“variancePartition”)
文档
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browseVignettes (“variancePartition”)
| R脚本 | 1)使用variancePartition教程 | |
| R脚本 | 2)额外的可视化 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | GeneExpression,RNASeq,回归,软件 |
| 版本 | 1.6.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.2 (r - 3.2)(2年) |
| 许可证 | GPL (> = 2) |
| 取决于 | ggplot2,foreach,Biobase、方法 |
| 进口 | 质量,pbkrtest(> = 0.4 - 4),迭代器样条函数,colorRamps,gplots,reshape2,lme4-10年(> = 1.1),doParallel,limmagrDevices,图形,跑龙套,统计数据 |
| 链接 | |
| 建议 | 刨边机,dendextend,tximport,tximportData,舞会礼服,DESeq2,readr,knitr,BiocStyle |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | variancePartition_1.6.0.tar.gz |
| Windows二进制 | variancePartition_1.6.0.zip |
| Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) | variancePartition_1.6.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/variancePartition |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/variancePartition/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
