要安装此软件包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ tximport”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。
生物导体版本:版本(3.5)
进口笔录级丰度,估计计数和转录本长度,并将其汇总到矩阵中,以与下游基因级分析软件包一起使用。通过样品特异性转录物丰度估计加权的平均转录本长度作为矩阵提供,可用作基因级数不同表达的偏移。
作者:Michael Love [CRE,AUT],Charlotte Soneson [Aut],Mark Robinson [Aut],Rob Patro [CTB],Andrew Parker Morgan [CTB],Ryan C. Thompson [CTB],Matt Shirley [CTB]
维护者:迈克尔·洛夫(Michael Love)
引用(从r内,输入引用(“ tximport”)
):
要安装此软件包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ tximport”)
html | R脚本 | 带有TXIMPORT的转录本丰度数据集 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | DataImport,,,,基因表达,,,,rnaseq,,,,软件,,,,转录 |
版本 | 1.4.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.3(R-3.3)(1。5年) |
执照 | GPL(> = 2) |
要看 | |
进口 | UTILS |
链接 | |
建议 | 尼特,,,,rmarkDown,,,,测试,,,,tximportdata,,,,txdb.hsapiens.ucsc.hg19,,,,readr(> = 0.2.2),林玛,,,,EDGER,,,,deseq2(> = 1.11.6),RHDF5,,,,rjson |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | 评分 |
建议我 | deseq2,,,,方差分区 |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | tximport_1.4.0.tar.gz |
Windows二进制 | tximport_1.4.0.zip |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | tximport_1.4.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/tximport |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/tximport/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |