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DOI:10.18129 / B9.bioc.traseR

基因组间隔中GWAS特征相关SNP富集分析

Bioconductor版本:Release (3.5)

traseR使用不同的假设检验方法在基因组间隔内执行GWAS特征相关的SNP富集分析，还提供了各种功能来探索和可视化结果。

作者:李晨，秦朝晖

维护者:李晨<李。陈在emory.edu>

安装

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文档

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browseVignettes(“tra利用”)

PDF	R脚本	在基因组区间进行GWAS特征相关SNP富集分析
PDF		参考手册

细节

biocViews	对齐,报道,DataImport,遗传学,质量控制,测序,软件
版本	1.6.0
在Bioconductor	BioC 3.2 (R-3.2)(2年)
许可证	GPL
取决于	R (>= 3.2.0)，GenomicRanges,IRanges,BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19
进口
链接
建议	BiocStyle,RUnit,BiocGenerics
SystemRequirements
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包档案

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源包	traseR_1.6.0.tar.gz
Windows二进制	traseR_1.6.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	traseR_1.6.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/traseR
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/traseR/
软件包下载报告	下载数据